माना जाता है कि होली के दिन होलिका पूजा करने से हर तरह के भय पर विजय प्राप्त की जा सकती है। होलिका पूजा शक्ति, समृद्धि और धन प्रदान करती है। ऐसा माना जाता है कि होलिका की रचना सभी प्रकार के भय को दूर करने के लिए की गई थी। 
धार्मिक ग्रंथों में होलिका दहन से पहले होलिका पूजा का सुझाव दिया गया है। होलिका दहन हिन्दू पंचांग से परामर्श करके उचित समय पर करना चाहिए। होलिका दहन सही समय पर करना महत्वपूर्ण है क्योंकि गलत समय पर करने से दुर्भाग्य और कष्ट हो सकता है।
पूजा के लिए इन सामग्रियों का उपयोग किया जाना चाहिए: एक कटोरी पानी, गाय के गोबर से बनी माला, रोली, चावल जो टूटे नहीं।  अगरबत्ती और फूल,कच्चे सूती धागे, हल्दी टुकड़े, मूंग की साबुत दाल, बताशा, गुलाल पाउडर और नारियल। साथ ही गेहूं और चना जैसी ताजी फसलों को पूजा सामग्री में शामिल किया जा सकता है।
जिस स्थान पर होलिका रखी जाती है, उस स्थान को गाय के गोबर और पवित्र जल से धोया जाता है। बीच में एक लकड़ी का खंभा रखा जाता है।  आमतौर पर गाय के गोबर से बनी होलिका और प्रह्लाद की मूर्तियों को ढेर के ऊपर रखा जाता है। होलिका ढेर को गाय के गोबर से सजाया जाता है। होलिका दहन के दौरान प्रहलाद की मूर्ति निकाली जाती है। साथ ही गाय के गोबर के चार मनके अलाव से पहले सुरक्षित रख लिए जाते हैं। एक पितरों के नाम पर, दूसरा भगवान हनुमान के नाम पर, तीसरा देवी शीतला के नाम पर और चौथा परिवार के नाम पर सुरक्षित रखा जाता है।